پژوهشگاه دانش‌های بنیادی با همکاری انجمن فیزیک ایران از سال ۱۳۹۰ به رساله‎ های برتر دکتری فیزیک که در داخل کشور تهیه شده باشند جایزه‌ای به نام «جایزۀ علیمحمـدی» اعـطا می‌کند. این جایزه به پاس خدمات علمی و دانشگاهی شهید دکتر مسعود علی محمدی استاد فقید دانشگاه تهران و اولین دانش‌آموختۀ دکتری فیزیکِ داخل کشور، از جمله نقش مؤثرش در زیرساخت علمی پژوهشگاه دانش‌های بنیادی و تلاش‌های وی برای برپایی تحصیلات تکمیلی در ایران، به نام او نامگذاری شده است.

این جایزه در سال ۱۴۰۲ به رساله‌های دکتری برگزیده در رشتۀ فیزیک که در داخل کشور تهیه شده و طی سال‌های ۱۳۹۸ الی ۱۴۰۱ مرحلۀ دفاع را گذرانده باشند، اعطا می‌شود.
برای ورود به مرحلۀ داوری، لازم است کارهای پژوهشی انجام‌شده در دورۀ دکتری و رسالۀ حاصل از آن، به تشخیصِ حداقل سه عضو هیئت علمیِ استادیار به بالا، که استاد راهنمای رسالۀ دکتری نیز یکی از آنان است، به عنوان «رسالۀ ممتاز» شناخته شده باشد. نامزدی هر شرکت‌کننده باید کتباً توسط استاد راهنما با ذکر اطلاعات مربوط به متقاضی، دلایل، مستندات، و مقالات مستخرج از رساله اعلام شود توصیه‌نامۀ حداقل ۲ استاد تأییدکنندۀ دیگر می‌بایست پس از ثبت نام متقاضی توسط اساتید به آدرس پست الکترونیکی amprize@ipm.ir ارسال شود.

ثبت‌نام متقاضی و بارگذاری مدارک و مستندات، لازم است تا تاریخ ۱۶ فروردین‌ماه ۱۴۰۲در پایگاه اینترنتی زیر انجام شود.

http://ipm.ir/alimohammadi

رساله‌های برتر پس از بررسی مدارک ارسالی و استفاده از نظرات مشاوران علمی انتخاب می‌شود.